Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Gm2056J3QQ02 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms