Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccer2J3QPU5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms