Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm8356J3QPD3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms