Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Gm21797J3QNW5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm21797J3QNW5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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