Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r39G3UWE6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms