Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ercc6F8VPZ5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ercc6F8VPZ5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ercc6F8VPZ5 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms