Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

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Length 94 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3443F7CCV5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3443F7CCV5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3443F7CCV5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3443F7CCV5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Gm3443F7CCV5 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm3443F7CCV5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm3443F7CCV5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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