Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SmgcF6VRN1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SmgcF6VRN1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms