Protein–RNA interactions for Protein: F6V035

Ccdc149, Coiled-coil domain-containing 149, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc149F6V035 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc149F6V035 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms