Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rdh16f1E9Q9P8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Rdh16f1E9Q9P8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rdh16f1E9Q9P8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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