Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Urb2E9Q7L1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Urb2E9Q7L1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms