Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fndc1E9Q043 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fndc1E9Q043 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms