Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ccdc144bE9PVZ3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc144bE9PVZ3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms