Protein–RNA interactions for Protein: E9PUD6

Zscan18, Zinc finger and SCAN domain-containing 18, mousemouse

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan18E9PUD6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zscan18E9PUD6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms