Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp6ap1lD3Z5W0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atp6ap1lD3Z5W0 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms