Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rnf217D3YYI7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rnf217D3YYI7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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