Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
9230113P08RikD3YWX3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
9230113P08RikD3YWX3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms