Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nxpe3B9EKK6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nxpe3B9EKK6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms