Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Clip3B9EHT4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Clip3B9EHT4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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