Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Phf11bB4XVQ1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Phf11bB4XVQ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Phf11bB4XVQ1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Phf11bB4XVQ1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Phf11bB4XVQ1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Phf11bB4XVQ1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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