Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cfap58B2RW38 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cfap58B2RW38 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms