Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rrn3B2RS91 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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