Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
JrklB2RRL2 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
JrklB2RRL2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms