Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PtprsB0V2N1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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PtprsB0V2N1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PtprsB0V2N1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms