Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Odf2A3KGV1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Odf2A3KGV1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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