Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plcb2A3KGF7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plcb2A3KGF7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plcb2A3KGF7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Plcb2A3KGF7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms