Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Palm3A2TJV2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Palm3A2TJV2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms