Protein–RNA interactions for Protein: A2AUC9

Klhl41, Kelch-like protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl41A2AUC9 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Klhl41A2AUC9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms