Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Col9a3A2ACT7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms