Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm16A2A935 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm16A2A935 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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