Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Calcoco2A2A6M5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms