Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSB3

Gm3880, Predicted pseudogene 3880, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3880A0A1B0GSB3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Gm3880A0A1B0GSB3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms