Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn2r25W4VSP2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms