Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Stk39Q9Z1W9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms