Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Thbs4Q9Z1T2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Thbs4Q9Z1T2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms