Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sept3Q9Z1S5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sept3Q9Z1S5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms