Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cacna2d3Q9Z1L5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms