Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1F6

Cnmd, Leukocyte cell-derived chemotaxin 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnmdQ9Z1F6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CnmdQ9Z1F6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CnmdQ9Z1F6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms