Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldn9Q9Z0S7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cldn9Q9Z0S7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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