Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx1Q9WV80 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx1Q9WV80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms