Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp18Q9WTV6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp18Q9WTV6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Usp18Q9WTV6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp18Q9WTV6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp18Q9WTV6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp18Q9WTV6 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp18Q9WTV6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Usp18Q9WTV6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Usp18Q9WTV6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp18Q9WTV6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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