Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU0

Phf2, Lysine-specific demethylase PHF2, mousemouse

Predictions only

Length 1,096 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf2Q9WTU0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Phf2Q9WTU0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phf2Q9WTU0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms