Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vax2Q9WTP9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vax2Q9WTP9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms