Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmed2Q9R0Q3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms