Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Plod3Q9R0E1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Plod3Q9R0E1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms