Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Sh2d3cQ9QZS8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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