Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Col4a3Q9QZS0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a3Q9QZS0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a3Q9QZS0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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