Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Col4a4Q9QZR9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Col4a4Q9QZR9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms