Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nr4a3Q9QZB6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nr4a3Q9QZB6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms