Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps29Q9QZ88 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vps29Q9QZ88 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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